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英国OGT牛津基因 aCGH芯片
澳门永利手机版      英国牛津基因OGT(Oxford Gene Technology)是由Edwin Southern教授于1995年创立,Southern教授是Southern blot印记杂交方法的发明人(1975年)。OGT产品具有三方面的独特之处:独特探针设计并结果可靠的aCGH芯片、高效率的标记试剂盒,无需Digest基因组DNA,简化实验步骤,缩短时间并保证了极低的DLR值和更高的信噪比、全球唯一具备interpret功能强大并简单易用的软件,软件直接注释出每一个报告的畸变所对应的基因和相关综合征的详细信息并直接连接到相关数据库,可以很方便的进行分类。

    OGT的aCGH芯片是安捷伦的定制芯片,可以在Agilent和AXON的芯片扫描仪上进行扫描,扫描分辨率要求:8x60k为2um或3um,8x15k为5um。得出的Feature Extraction之后的数据用OGT软件进行分析,同时OGT也可以将安捷伦aCGH的数据进行转换后,利用OGT软件处理数据并给出结果。

    OGT公司的CytoSure系列aCGH芯片是采用安捷伦的原位Ink-Jet打印技术,在光洁的玻璃载体表面上进行探针原位合成,探针长度为60mer,所有探针均由英国OGT设计并同国际细胞基因芯片标准化联合会共同验证-International Standards for Cytogenomic Arrays (ISCA) Consortium。英国OGT公司于2009年与全球24位著名的人类遗传学家合作在OGT aCGH芯片平台上成功完成了由Wellcome Trust Sanger研究院(Wellcome Trust Case Control Consortium, WTCCC,或称Wellcome Trust病例对照研究协会) 送检的20000例标本的全球最大规模的CNV研究项目。在此过程中,英国OGT公司筛选出经过严格验证的2400万个探针。如今,基于这个经过严格验证的2400万的探针库,OGT公司设计了多种用途的人类基因组aCGH芯片,包括CNV、CNV+SNP(LOH)、CNV+UPD、DMD、Aneuploidy、Chromosome X、神经肌肉系统疾病、新生儿代谢病、发育迟缓和孤独症、血液病、实体瘤等。所有芯片具备多种分辨率选择:8 x 60k、4 x 180k、4 x44k、4 x 105k、8 x 15k以及Custom Array定制芯片。OGT aCGH芯片在欧洲和美国被普遍认同并广泛使用。

芯片特点:

  1. 探针高密度覆盖人类全基因组---对疾病相关区域实行高密度覆盖,包括CNV、CNV+SNP(LOH)、CNV+UPD、DMD、Aneuploidy、Chromosome X、神经肌肉系统疾病、新生儿代谢病、发育迟缓和孤独症、血液病、实体瘤等。
  2. 探针灵敏度高,特异性好 ---60-mer寡核苷酸,保证了极低的DLR值和更高的信噪比。
  3. 提供8x60k,  8x15k, 4x44k, 4x180k, 2x105k及定制芯片
  4. 澳门永利娱乐场手机板-- 采用安捷伦的原位Ink-Jet打印技术,在光洁的玻璃载体表面上进行探针原位合成。
  5. 简化实验流程,缩短检测时间--基因组DNA无需Digestion,可直接标记,比传统Digest方法可节省1天时间 。
  6. 澳门永利娱乐场手机板---简便、易用,兼容性高,可直接注释出每一个畸变所对应的基因及其相关综合征的详细信息并直接链接到相关数据库。

芯片检测流程:

  1. 实验基因组DNA与对照组基因组DNA直接进行标记
  2. 样品混合后与芯片进行杂交
  3. 清洗,Agilent或Axon扫描仪上进行扫描,提取Feature并将其导入CytoSureTM解析软件进行数据分析

选择OGT基因芯片的理由:


理由一: CytoSure  aCGH芯片流程省去基因组DNA Digestion,并极大减少人工操作时间。


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CytoSure CNV+SNP芯片流程(左)与传统SNP流程(右)对比,CytoSure CNV+SNP芯片流程省去基因组DNA Digestion,并极大减少人工操作时间。

理由二:节省成本,不需要文库质控

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理由三:CytoSure软件快速给出所发现的畸变的临床意义


 

CytoSureTM解析软件优势 永利官网

CytoSureTM解析软件是一款强大的aCGH数据分析软件,且简单易学。软件包括标准工作流程和用户自定义工作流程两种模式,标准工作流程可自动化完成数据分析,极大减少用户干预;自定义工作流程可允许用户根据自身实验要求自行设定分析流程。该软件随CytoSure aCGH芯片免费且独家提供。

CytoSureTM解析软件优势如下:

  1. 简单、快速、准确分析aCGH数据
  2. 软件可直接连接到外部数据库以及网上资源,对数据进行综合注释。
  3. 强大的关系型数据库,可进行复杂的数据查询和筛选
  4. 广泛的自定义选项,满足您不同的实验要求
  5. 软件不断的创新与更新,确保数据分析的先进性

CytoSure Interpret Software全面制定的跟踪链接简化了畸变结果的注释过程

CytoSure解析软件的自动SNP和LOH检测。暗红色矩形表示LOH区域。绿色和亮红色矩形分别表示扩增和缺失。图中显示相同的CLL样品,并清楚地示出p13.31-p12.3的p臂端粒区域和LOH区域的扩增。

CytoSure Interpret Software全自动染色体异常检测清晰显示染色体异常:癌症基因普查基因跟踪可轻松检测到慢性淋巴细胞性白血病(CLL)样品的12号染色体中包含锌脂蛋白基因ZP384。 

应用方面:

  • 产前产后基因诊断
  • 植入前基因诊断
  • 临床遗传学研究
  • 细胞遗传学研究
  • 分子遗传学研究
  • 血液病学研究
  • 癌症研究                                         

产品订购信息:


 Genome-wide Arrays

 Product                                     Contents  Cat.no
 CytoSure ISCA v2 (4x44k)  Microarray with four arrays of 44,000 spots; CytoSure Interpret  Software  020042
 CytoSure ISCA v2 (8x60k)  Microarray with eight arrays of 60,000 spots, featuring spike-in control;    CytoSure Interpret Software  020040
 CytoSure ISCA v2 (4x180k)  Microarray with four arrays of 180,000 spots, featuring spike-in control;    CytoSure Interpret Software  020041
 CytoSure ISCA +SNP(4x180k)  Microarray with four arrays of 180,000 spots;CytoSure Interpret Software  020051
 CytoSure ISCA UPD (4x180k)*  Microarray with four arrays of 180,000 spots; CytoSure Interpret Software  020050
 CytoSure Syndrome Plus v2 (2x105k)  Microarray with two arrays of 105,000 spots;CytoSure Interpret Software  020019
 CytoSure Aneuploidy (8 x 15k)*   Microarray with eight arrays of 15,000 spots;CytoSure Interpret Software  020024
 CytoSure Single Cell Aneuploidy (8 x 15k)  Microarray with eight arrays of 15,000 spots optimised for research usingamplified DNA  020043

 Gene-focused arrays

 product  content  cat.no
 CytoSure Molecular Testing Array A (8x60k)*  Microarray with eight arrays of 60,000 spots; CytoSure Interpret Software. Content focus: neuromuscular disorders.  020062
 CytoSure Molecular Testing Array B (4x180k)  Microarray with four arrays of 180,000 spots; CytoSure Interpret Software. Content focus: in-born metabolic disorders  020061
 CytoSure Molecular Testing Array C (4x180k)  Microarray with four arrays of 180,000 spots; CytoSure Interpret Software. Content focus: mental retardation and autism  020060
 CytoSure Custom Molecular Testing Array (various formats)  Microarray with a choice of formats; CytoSure Interpret Software  020018
 CytoSure DMD (4x44k)*  Microarray with four arrays of 44,000 spots; CytoSure Interpret Software   020023
 CytoSure Cancer +SNP array (4x180k)  Microarray with four arrays of 180,000 spots; CytoSure Interpret Software  700090
 CytoSure Haematological Cancer +SNP(8x60k)  Microarray with eight arrays of 60,000 spots; CytoSure Interpret Software  020070

 Chromosome-specific arrays

 Product  Contents  Cat.no
 Chromosome X (4x44k)  Microarray with four arrays of 44,000 spots; CytoSure Interpret Software  020015
 Chromosome X (2x105k)   Microarray with four arrays of 105,000 spots; CytoSure Interpret Software  020021

 Custom Designed aCGH Arrays

 Product                      Contents  Cat.no
 CytoSure Custom Array  Microarray with a choice of formats; CytoSure Interpret software  020018

 CytoSure™ Interpret Software

 Product  Contents  Cat.no
 CytoSure Interpret Software  Class-leading microarray analysis software. Complimentary with all CytoSure arrays  020022

 

 
暂无内容
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